De acordo com o site Fandom Wire, a Disney e a Marvel cortaram na edição final qualquer referência ou relação que o longa (Os Novos Mutantes) tinha com o universo dos X-Men da FOX, e não apenas isso como também teriam mudado pontos chaves da obra, como o sentido da palavra “mutante”. Assim tendo como principal propósito a possibilidade de usar os personagens do filme com os mesmos atores só que introduzidos no Universo Cinematográfico da Marvel (MCU).
O portal Fandom Wire ainda divulgou o que pode ser a nova trama que o longa pretende seguir:
“A história é ambientada em um laboratório secreto que faz testes em mutantes. A protagonista, Miragem (Blu Hunt) não sabe que é uma mutante ou o significado dessa palavra. Miragem é levada ao laboratório após um ataque do Urso Místico”
Nem a Disney e nem a Marvel se manifestaram contra ou a favor desses rumores.